Скалли и Малдер расследуют загадочное исчезновение полковника Будахаса, являющегося военным летчиком-испытателем, который (как стало ясно позже) испытал некое психическое расстройство и был сразу же госпитализирован. Малдер думает, что Будахас, испытал такую же судьбу, как шесть других летчиков, загадочно пропавших с авиабазы Элленс после своего участия в испытаниях экспериментальных самолетов. Малдер полагает, что исчезновения эти тесно связаны с НЛО и могут классифицироваться в качестве случая из категории Секретных Материалов.С Малдером связался неизвестный ему человек - далее называемый "Глубокой Глоткой", который желает убедить его закрыть данное расследование. Однако, Скалли и Малдер игнорируют данный совет и беседуют с госпожой Будахас, описывающей непредсказуемое поведение собственного мужа, появление какой-то сыпи на коже, а также отвращение к процессу обсуждения его работы в различных военных секретных проектах.
Агенты думают, что пилоты, были как-то связаны с проектом под названием «Аврора», представляющим собой секретные испытания Пентагоном околоорбитальных аппаратов-шпионов.

Репортер по имени Пол Моссинжер нашел им жилье. Ночью Скалли и Малдер в изумлении увидели два весьма ярких объекта в ночном небе, которые маневрировали с невероятно огромной скоростью. Агентами были задержаны два подростка, Зои и Эмиль, которые сквозь отверстие в ограждении смогли проникнуть на территорию этой авиабазы. Четвером они пришли в ресторан, где Эмиль и Зои поведали о собственных наблюдениях на авиабазе. Малдер сказал Скалли, что военнослужащие используют самолеты, которые были построены на основе технологий, взятых у НЛО. Госпожа Будахас сообщила по телефону, что муж ее внезапно снова появился. Однако, Полковник не помнит каких- либо деталей, имеющих отношение к своему недавнему прошлому. Малдер думает, что память Будахаса так либо иначе сознательно была стерта, и что он также, как другие пилоты, летавшие на таинственных летательных аппаратах, - является неспособным психически к подобным полетам. Агентов захватили люди, являющиеся представителями "службы безопасности". Они уничтожили все фотографии и приказали, чтобы город ими был покинут. Однако, Малдер решил, подобно Зои и Эмили проникнуть на территорию авиационной базы сквозь отверстие в заборе. Между тем, он слишком далеко зашел и был замечен НЛО. Он был сразу же пойман. Далее работали над ним люди, весьма похожие на врачей. Моссинжер сразу же напал на агента Скалли, когда узнал, что она смогла обнаружить его работу на военных.

Однако, Скалли обезвредила его, взяв в заложники. Она использовала Моссинжера, чтобы обнаружить Малдера и когда она узнала, что он находится на авиабазе, то решила выменять Малдера на Моссинжера. Однако, когда он был возвращен, он не смог вспомнить свое столкновение с НЛО и вообще что происходило, в то время, когда он находился на базе из-за своего "лечения". В городе Вашингтоне, Малдер снова встретился на стадионе с Глубокой Глоткой. И он предупредил Малдера, что тот выбрал весьма опасный путь, и их собственные жизни теперь находятся в большой опасности, так как  они узнали правду о факте существования внеземной цивилизации.